MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758994
2	NC_003198	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758994
3	NC_003198	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
4	NC_003198	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	16758995
5	NC_003198	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
6	NC_003198	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
7	NC_003198	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	16758995
8	NC_003198	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
9	NC_003198	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	16758995
10	NC_003198	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
11	NC_003198	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
12	NC_003198	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
13	NC_003198	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	16758995
14	NC_003198	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	16758995
15	NC_003198	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
16	NC_003198	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
17	NC_003198	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
18	NC_003198	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
19	NC_003198	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
20	NC_003198	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
21	NC_003198	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
22	NC_003198	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
23	NC_003198	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758995
24	NC_003198	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
25	NC_003198	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
26	NC_003198	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
27	NC_003198	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
28	NC_003198	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16758995
29	NC_003198	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	16758995
30	NC_003198	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
31	NC_003198	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
32	NC_003198	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
33	NC_003198	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758995
34	NC_003198	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758995
35	NC_003198	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16758995
36	NC_003198	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758995
37	NC_003198	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
38	NC_003198	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
39	NC_003198	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758995
40	NC_003198	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
41	NC_003198	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
42	NC_003198	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758995
43	NC_003198	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
44	NC_003198	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758995
45	NC_003198	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758995
46	NC_003198	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
47	NC_003198	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758995
48	NC_003198	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
49	NC_003198	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
50	NC_003198	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
51	NC_003198	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
52	NC_003198	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
53	NC_003198	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
54	NC_003198	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
55	NC_003198	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
56	NC_003198	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
57	NC_003198	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
58	NC_003198	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	16758995
59	NC_003198	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16758995
60	NC_003198	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
61	NC_003198	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
62	NC_003198	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
63	NC_003198	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
64	NC_003198	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
65	NC_003198	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	16758996
66	NC_003198	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758996
67	NC_003198	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
68	NC_003198	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	16758996
69	NC_003198	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
70	NC_003198	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
71	NC_003198	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758996
72	NC_003198	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16758996
73	NC_003198	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
74	NC_003198	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
75	NC_003198	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	16758996
76	NC_003198	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
77	NC_003198	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
78	NC_003198	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	16758996
79	NC_003198	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	16758996
80	NC_003198	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758996
81	NC_003198	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
82	NC_003198	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758997
83	NC_003198	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	16758997
84	NC_003198	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
85	NC_003198	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758997
86	NC_003198	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	16758997
87	NC_003198	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
88	NC_003198	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
89	NC_003198	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	16758997
90	NC_003198	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758997
91	NC_003198	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	16758997
92	NC_003198	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
93	NC_003198	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
94	NC_003198	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758997
95	NC_003198	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
96	NC_003198	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758997
97	NC_003198	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758997
98	NC_003198	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
99	NC_003198	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	16758997
100	NC_003198	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	16758997
101	NC_003198	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16758997
102	NC_003198	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
103	NC_003198	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	16758997
104	NC_003198	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
105	NC_003198	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758997
106	NC_003198	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
107	NC_003198	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	16758997
108	NC_003198	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758997
109	NC_003198	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	16758997
110	NC_003198	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
111	NC_003198	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
112	NC_003198	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	16758998
113	NC_003198	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
114	NC_003198	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16758998
115	NC_003198	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
116	NC_003198	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	16758998
117	NC_003198	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	16758998
118	NC_003198	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758998
119	NC_003198	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
120	NC_003198	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758998
121	NC_003198	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758998
122	NC_003198	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	16758998
123	NC_003198	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	16758998
124	NC_003198	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758998
125	NC_003198	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16758998
126	NC_003198	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758998
127	NC_003198	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758998
128	NC_003198	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758998
129	NC_003198	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16758998
130	NC_003198	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	16758999
131	NC_003198	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758999
132	NC_003198	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758999
133	NC_003198	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	16758999
134	NC_003198	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
135	NC_003198	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
136	NC_003198	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758999
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265	NC_003198	CCG	2	6	13431	13436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759005
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268	NC_003198	A	6	6	13502	13507	100 %	0 %	0 %	0 %	16759005
269	NC_003198	TAC	2	6	13611	13616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759006
270	NC_003198	ATC	2	6	13690	13695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759006
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289	NC_003198	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	16759006
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299	NC_003198	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	16759007
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303	NC_003198	TTA	2	6	15323	15328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759007
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379	NC_003198	GAA	2	6	19751	19756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759011
380	NC_003198	GAT	2	6	19775	19780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759011
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383	NC_003198	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	16759011
384	NC_003198	CGG	2	6	19939	19944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759011
385	NC_003198	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759012
386	NC_003198	GACCAT	2	12	20060	20071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16759012
387	NC_003198	TCCA	2	8	20073	20080	25 %	25 %	0 %	50 %	16759012
388	NC_003198	A	6	6	20113	20118	100 %	0 %	0 %	0 %	16759012
389	NC_003198	TCA	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759012
390	NC_003198	GCG	2	6	20218	20223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759012
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393	NC_003198	ATC	2	6	20292	20297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759012
394	NC_003198	TAA	2	6	20300	20305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759012
395	NC_003198	CTT	2	6	20319	20324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759012
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